Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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