Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfaP20033 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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