Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NefhP19246 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NefhP19246 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NefhP19246 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NefhP19246 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms