Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhoP15409 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhoP15409 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RhoP15409 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RhoP15409 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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