Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmnb1P14733 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmnb1P14733 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms