Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nr4a1P12813 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms