Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd4P10628 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4P10628 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms