Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb4P10284 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb4P10284 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms