Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms