Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgfb1P04202 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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