Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01727 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01727 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01727 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01727 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms