Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01667 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01667 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms