Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl20O89093 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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