Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Foxq1O70220 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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