Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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