Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TsksO54887 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms