Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FxnO35943 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FxnO35943 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms