Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Edil3O35474 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Edil3O35474 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Edil3O35474 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms