Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms