Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Speer4dL7N216 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms