Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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