Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm21818J3KMS6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm21818J3KMS6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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