Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms