Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn20G5E8X0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Cldn20G5E8X0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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