Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms