Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4aF8VPX6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms