Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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