Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms