Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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