Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ccdc71lE9Q4T4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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