Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Susd1E9Q3H4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Susd1E9Q3H4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms