Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms