Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Krt78E9Q0F0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Krt78E9Q0F0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms