Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx60E9PZQ1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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