Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms