Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms