Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd1D3YXK1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms