Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mfap1aC0HKD8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms