Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Phf11bB4XVQ1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Phf11bB4XVQ1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms