Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf11cB4XVP9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf11cB4XVP9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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