Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms