Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms