Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prr16A3KMN5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr16A3KMN5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr16A3KMN5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prr16A3KMN5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms