Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GabreA2AMW3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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