Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nup62clA2AG10 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nup62clA2AG10 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms