Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pramef6A2A8M8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms