Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprfA2A8L5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms