Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms