Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Speer3W4VSP1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Speer3W4VSP1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Speer3W4VSP1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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