Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ilf3Q9Z1X4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms